Разница между кДНК и геномной ДНК

Основное различие - кДНК против геномной ДНК

Комплементарная ДНК (кДНК) и геномная ДНК - это два типа молекул ДНК, используемых в исследовательских экспериментах в молекулярной биологии. И кДНК, и геномная ДНК состоят из нуклеотидов ДНК. кДНК производится путем обратной транскрипции выделенной РНК из ткани. Типы РНК, используемые для обратной транскрипции, могут быть тотальной РНК, пре-мРНК, РНК, рибосомной РНК или тРНК. Однако геномную ДНК можно напрямую выделить из клетки. В главное отличие между кДНК и геномной ДНК заключается в том, что кДНК представляет собой транскриптом определенного организма, тогда как геномная ДНК представляет собой геном..

Ключевые области покрыты

1. Что такое кДНК - Определение, факты, роль 2. Что такое геномная ДНК - Определение, факты, роль 3. Каковы сходства между кДНК и геномной ДНК - Обзор общих черт 4. В чем разница между кДНК и геномной ДНК - Сравнение основных различий

Ключевые термины: комплементарная ДНК (кДНК), геном, геномная ДНК (гДНК), обратная транскрипция, РНК, транскриптом.

Что такое кДНК

кДНК (комплементарная ДНК) относится к синтетической ДНК, последовательности оснований которой комплементарны ДНК. Он производится путем обратной транскрипции матриц РНК. Общая РНК, пре-мРНК, РНК, рибосомная РНК или тРНК могут использоваться для обратной транскрипции. Обратная транскриптаза - это фермент, который катализирует реакцию производства кДНК из РНК. Обратная транскрипция в сочетании с ПЦР показана на рисунке 1.

Рисунок 1: Обратная транскрипция в сочетании с ПЦР

кДНК в основном используется при клонировании эукариотических генов в прокариотических геномах. Экзоны состоят из кодирующей области белков. У эукариот кодирующая область прерывается интронами. Во время транскрипции как интроны, так и экзоны кодируются в пре-мРНК. Но во время процессинга мРНК интроны удаляются из мРНК, производя зрелую мРНК путем сплайсинга экзонов вместе. Суммарная мРНК организма называется транскриптомом. Однако у прокариот отсутствуют механизмы обработки мРНК. Таким образом, мРНК используется для синтеза кДНК, которая содержит только белковые кодирующие области генома. Эта кДНК используется для клонирования генов в прокариотах. кДНК естественным образом вырабатывается в ретровирусах во время преобразования генома РНК в ДНК.

Что такое геномная ДНК

Геномная ДНК (гДНК) относится к общему набору хромосомной ДНК в геноме. Полный набор генов конкретного организма называется его геномом. Однако активны не только гены генома. Большинство групп организмов имеют похожие типы геномной ДНК внутри группы. Геном организма передается от следующего поколения к другому. Обычно геномы состоят из большого количества пар оснований. Например, геном человека состоит примерно из 3 миллиардов пар оснований. Хромосомы генома человека показаны на рисунке 2.

Рисунок 2: Хромосомы генома человека

Четыре типа последовательностей, обнаруженных в геномной ДНК, - это гены, кодирующие белок, тандемно повторяющиеся гены, повторяющаяся ДНК и спейсерная ДНК. Геномная ДНК используется во многих экспериментах в молекулярной биологии. Выделение геномной ДНК проще по сравнению с получением кДНК. Геномную ДНК можно использовать в качестве матриц ПЦР при клонировании, секвенировании, подготовке геномных библиотек, снятии отпечатков ДНК, изучении структур генов и обнаружении мутаций / аномалий.

Сходства между кДНК и геномной ДНК

Определение

кДНК: кДНК - это синтетическая ДНК, последовательности оснований которой комплементарны геномной ДНК.

Геномная ДНК: Геномная ДНК - это полный набор хромосомной ДНК в геноме.

Представлять

кДНК: кДНК представляет собой транскриптом.

Геномная ДНК: ДНК представляет собой геном.

Синтезировано / извлечено из

кДНК: кДНК синтезируется путем обратной транскрипции различных типов РНК.

Геномная ДНК: Геномная ДНК может быть извлечена из существующих геномов.

Содержание

кДНК: кДНК состоит из экзонов или кодирующих областей.

Геномная ДНК: Геномная ДНК состоит из кодирующих и некодирующих последовательностей организма.

Количество

кДНК: кДНК содержит несколько пар оснований.

Геномная ДНК: Геномная ДНК содержит большое количество пар оснований.

Использовать

кДНК: кДНК используется для создания библиотек кДНК.

Геномная ДНК: Геномную ДНК можно использовать для создания геномных библиотек.

Заключение

кДНК и геномная ДНК - это два типа молекул ДНК, используемых в различных типах экспериментов в молекулярной биологии. кДНК синтезируется из РНК и состоит только из экзонов. Следовательно, он представляет собой транскриптом организма. Геномную ДНК можно легко извлечь из ядра клетки. Он состоит как из кодирующих, так и из некодирующих областей. Он представляет собой геном конкретного организма. Основное различие между кДНК и геномной ДНК заключается в типе ДНК, присутствующей в каждом типе молекул ДНК.

Ссылка:

1. «КДНК (комплементарная ДНК)». Human Genes, доступно здесь 2. «ГДНК - Геномная ДНК | Advanced Analytical (AATI) ». Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), доступно здесь 3. «Выделение и применение геномной ДНК». Scribd, доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией» Автор: Jpark623 - собственная работа (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia2. «Человеческий геном к генам» (CC BY 2.0) через Commons Wikimedia