В главное отличие между гибридизацией колонии и бляшки заключается в том, что Гибридизация колоний - это метод, используемый для отбора бактериальных колоний с желаемыми генами, тогда как гибридизация бляшек - это метод отбора фагов с желаемыми генами. Кроме того, гибридизация колоний может использоваться при скрининге библиотек на основе плазмид или космид, тогда как гибридизация бляшек может использоваться при скрининге фаговых библиотек.

Гибридизация колоний и бляшек - это два метода, используемые при скрининге геномных библиотек или библиотек кДНК. Их еще называют колония лифт а также бляшечный подъемник соответственно.

Колония, гибридизация колоний, скрининг библиотеки, бляшка, гибридизация бляшек

Что такое гибридизация колоний

Гибридизация колоний - это метод скрининга, используемый для отбора бактериальных колоний с желаемой последовательностью ДНК. Его еще называют колониальная блот-гибридизация, лифтинг колоний или покрытие реплики. Это позволяет проводить скрининг колоний, высеянных с высокой плотностью. Первоначальная процедура гибридизации колоний была впервые разработана Грюнштейном и Хогнессом. Во-первых, бактериальные колонии могут быть трансформированы на мембрану, и бактериальные колонии лизируются, обнажая нуклеиновые кислоты. Затем экспонированные нуклеиновые кислоты фиксируются на мембране путем их денатурации и гибридизуются с радиоактивными зондами.

Рисунок 1: Метод гибридизации колоний

Колония - это скопление бактерий, возникшее из одной бактериальной клетки в результате бесполого размножения. Следовательно, все бактериальные клетки в конкретной колонии обладают одинаковым генетическим составом, как и трансформированный генетический материал. Обычно бактерии трансформируют с помощью плазмидных или космидных векторов.

Что такое гибридизация зубного налета

Гибридизация бляшек - это метод скрининга рекомбинантных фагов. Это модификация гибридизации колоний Бентоном и Дэвисом в 1977 году. Метод также называется бляшечный подъемник. Процедура гибридизации бляшек аналогична процедуре гибридизации колоний, и бляшки поднимаются путем их контакта с нитроцеллюлозной мембраной. Затем нуклеиновые кислоты экспонируются и фиксируются на мембране, гибридизуются с желаемыми зондами.

Рисунок 2: Бляшки на чашке с агаром

Зубной налет - это прозрачная зона на агаровой пластине, продуцируемая конкретным бактериофагом в результате лизиса бактериальных клеток в этой области. Из-за меньшего количества ДНК, перенесенной на нитроцеллюлозную мембрану, гибридизация бляшек дает меньше фоновых сигналов.

Сходства между гибридизацией колоний и бляшек

Разница между гибридизацией колоний и бляшек

Определение

Гибридизация колоний относится к способу отбора бактериальных колоний с желаемыми генами, тогда как гибридизация бляшек относится к способу скрининга, используемому для идентификации рекомбинантных фагов.

Разработано

Гибридизация колоний была впервые разработана Грюнштейном и Хогнессом, а гибридизация бляшек была впервые разработана Бентоном и Девисом в 1977 году.

Типы библиотек

Гибридизация колоний включает идентификацию библиотек на основе плазмид или космид, тогда как гибридизация бляшек включает идентификацию фаговых библиотек.

Количество лифтов

Колонии можно поднимать за один раз, а бляшки можно поднимать несколько раз.

Фоновые сигналы

Заключение

Гибридизация колоний представляет собой метод скрининга бактериальных колоний в библиотеках, полученных с помощью плазмидных или космидных векторов. С другой стороны, гибридизация бляшек - это метод скрининга бактериофагов в фаговых библиотеках. Основное различие между гибридизацией колоний и бляшек заключается в типах библиотек, проверяемых каждым методом.

Ссылка:

1. Каксонен, Анна. «Молекулярные подходы к анализу микробного сообщества». Выщелачивание - BioMineWiki, 20 апреля 2006 г., доступно здесь 2. Дейл, Дж. У. и П. Дж. Гринуэй. «Идентификация рекомбинантных фагов путем гибридизации бляшек». Методы молекулярной биологии (Клифтон, Нью-Джерси), Национальная медицинская библиотека США, доступно здесь

Изображение предоставлено:

1. «Блот-гибридизация» Каксонена - http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (общественное достояние) через Commons Wikimedia 2. «М. smegmatis plaque »Автор: Wazzzup7up - собственная работа (общественное достояние) через Commons Wikimedia