Основное различие - геномика против протеомики

Геномика, протеомика и метаболомика - это области, вовлеченные в изучение и классификацию живых существ с помощью их геномов, белковых продуктов, синтезируемых на основе генетических инструкций, и типа молекул, которые они метаболизируют, соответственно. Геномика и протеомика - тесно связанные области. В главное отличие между геномикой и протеомикой заключается в том, что геномика - это изучение всего набора генов в геноме клетки, тогда как протеомика - это изучение всего набора белков, производимых клеткой.. С другой стороны, метаболомика - это изучение всего набора низкомолекулярных соединений, которые служат субстратами и побочными продуктами ферментативных реакций клетки.

Ключевые области покрыты

1. Что такое геномика - Определение, методы, классификация 2. Что такое протеомика - Определение, методы, классификация 3. Каковы сходства между геномикой и протеомикой - Обзор общих черт 4. В чем разница между геномикой и протеомикой - Сравнение основных различий

Ключевые термины: гены, геномика, проект генома человека (HGP), проект протеома человека (HPP), белки, протеом, протеомика.

Что такое геномика

Геномика относится к изучению всего набора генов в геноме. Геном - это полный набор генетической информации об организме, в основном состоящий из ДНК. В геномике используются высокопроизводительные методы для картирования, секвенирования и анализа геномов. Методы, используемые в геномике, включают стратегии секвенирования генов, такие как направленное секвенирование генов, дробное секвенирование всего генома, построение тегов экспрессируемых последовательностей (EST), идентификация однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), а также анализ и интерпретация секвенированных данных с использованием различного программного обеспечения и базы данных. Основные этапы последовательности действий при стрельбе из дробовика показаны на рисунке 1.

Рисунок 1: Последовательность действий в окружающей среде для дробовика (ESS)Отбор проб, (B) фильтрация частиц, (C) экстракция и лизис ДНК, (D) клонирование и библиотека, (D) секвенирование, (E) сборка последовательности

Двумя основными областями геномики являются структурная геномика и функциональная геномика. В структурная геномикаструктура и взаимное расположение генов изучаются, в то время как в функциональная геномика, изучаются функция или роль генов в регуляции метаболической активности. Проекты секвенирования генома - это последняя разработка в области геномики. Проект "Геном человека" (HGP) был завершен в 2003 году. Цели проекта "Геном человека" заключались в следующем:

Помимо генома человека, геномам мышей и риса также подвергались геномные исследования.

Что такое протеомика

Протеомика относится к изучению всего набора белков, производимых клеткой. Протеом - это полный набор белков, производимых клеткой. В протеомике характеристика трехмерной структуры и функции белков осуществляется с помощью высокопроизводительных методов. Методы, используемые в протеомике, включают экстракцию и электрофоретическое разделение белков, расщепление белков с использованием трипсина на небольшие фрагменты, определение аминокислотной последовательности с помощью масс-спектрометрии и идентификацию белков с использованием информации в базах данных белков. Более того, трехмерную структуру белка можно предсказать с помощью программных методов. Экспрессию белков можно изучать с помощью белковых микрочипов. Карты белковой сети могут быть разработаны для определения белок-белковых взаимодействий. Различные явления протеомики показаны на рисунке 2.

Рисунок 2: Протеомика

Белковые продукты генов человеческого генома изучаются в рамках проекта Human Proteome Project (HPP). Одна из основных целей проекта «Протеом человека» - выявить белки, вызывающие основные заболевания.

Сходства между геномикой и протеомикой

Разница между геномикой и протеомикой

Определение

Геномика: Геномика относится к изучению всего набора генов в геноме.

Протеомика: Протеомика относится к изучению всего набора белков, производимых клеткой.

Явления

Геномика: Геномика включает картирование, секвенирование и анализ геномов.

Протеомика: Протеомика включает трехмерную структуру и функцию белков, а также белок-белковые взаимодействия.

Классификация

Геномика: Два типа геномики - это структурная геномика и функциональная геномика.

Протеомика: Три типа протеомики - это структурная, функциональная и экспрессионная протеомика.

Важные области

Геномика: Проекты секвенирования генома, такие как Human Genome Project, являются важными областями геномики.

Протеомика: Разработка протеомных баз данных, таких как SWISS-2DPAGE, и разработка программного обеспечения для компьютерного дизайна лекарств, являются важными областями протеомики.

Заключение

Геномика и протеомика - две научные области, используемые при изучении организмов. Геномика - это изучение всего набора генов в организме, тогда как протеомика - это изучение всего набора белков, производимых клеткой. Основное различие между геномикой и протеомикой - это критерии каждой области при изучении организмов.

Ссылка:

1. Гриффитс, Энтони Дж. Ф. «Геномика: обзор». Введение в генетический анализ. 7-е издание, Национальная медицинская библиотека США, 1 января 1970 г., доступно здесь. Безграничный. «Геномика и протеомика». Геномика и протеомика | Безграничная биология, доступная здесь 3. Грейвс, Пол Р. и Тимоти А. Дж. Хейстед. «Руководство молекулярного биолога по протеомике». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии, Американское общество микробиологов, март 2002 г., доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Экологическое секвенирование дробовика» Джон К. Вули, Адам Годзик, Иддо Фридберг - (CC BY 2.5) через Commons Wikimedia2. «Proteomics» Автор Xxl7441 в английских Викиучебниках - перенесено из en.wikibooks в Commons. (Общественное достояние) через Commons Wikimedia